Perjuangan pembebasan di Tanganyika dipimpin oleh Uni Nasional Afrika Tanganyika, yang benderanya berwarna hijau-hitam-hijau horisontal. Pemilihan menegaskan dukungan rakyat yang luar biasa untuk organisasi, dan otoritas Inggris menyarankan memodifikasi bendera partai untuk digunakan sebagai bendera nasional setelah kemerdekaan pada 9 Desember 1961. Fimbriation kuning ditambahkan pada waktu itu.
Di bawah pemerintahan Arab, Zanzibar telah lama mengibarkan bendera merah, tetapi sebuah rezim kulit hitam Afrika berkuasa pada 12 Januari 1964, di bawah bendera hitam, kuning, dan biru. Bulan berikutnya, Partai Afro-Shirazi yang berkuasa memperkenalkan bendera nasional baru yang serupa dengan bendera nasionalnya. Garis-garis horizontal biru-hitam-hijau berdiri untuk laut, orang-orang, dan tanah, masing-masing, sedangkan garis vertikal putih sempit di hoist adalah untuk perdamaian.
Pada bulan April 1964 negara-negara Tanganyika dan Zanzibar bersatu, dan pada awal Juli tradisi bendera mereka menyatu untuk membuat bendera nasional baru Tanzania. Warna-warna bendera dimasukkan secara diagonal untuk kekhasan. Populasi mayoritas negara itu dilambangkan oleh garis hitam, sementara hijau menunjukkan sumber daya pertanian yang kaya dari tanah. Kekayaan mineral tercermin di perbatasan kuning yang sempit, sedangkan Samudra Hindia dilambangkan dengan warna biru. Setelah Zanzibar bersatu dengan Tanganyika, bendera Zanzibar tetap digunakan secara lokal di pulau-pulau itu.
