Chromophore, sekelompok atom dan elektron yang membentuk bagian dari molekul organik yang membuatnya diwarnai.
Korelasi antara fitur struktural senyawa kimia dan warnanya telah dicari sejak sekitar tahun 1870, ketika dicatat bahwa kuinon dan senyawa azo dan nitro aromatik sering sangat berwarna dan bahwa warna berkurang atau dihancurkan ketika senyawa dihidrogenasi. Kemampuan suatu senyawa untuk mengambil hidrogen, disebut tidak jenuh, disebabkan oleh adanya elektron yang tidak terikat kuat dalam ikatan kovalen antara pasangan atom tertentu tetapi menempati wilayah ruang yang lebih besar (orbital molekul) yang mungkin terkait dengan beberapa atom.. Elektron ini dapat menyerap energi dari cahaya pada rentang panjang gelombang tertentu di wilayah yang terlihat; transmisi atau refleksi sisa cahaya memunculkan warna senyawa yang diamati. Pewarnaan dalam terjadi jika beberapa kromofor bergabung erat dalam molekul yang sama atau jika ada kelompok lain, yang disebut auksokrom.
