Michael Haydn, sepenuhnya Johann Michael Haydn, (dibaptis 14 September 1737, Rohrau, Austria — meninggal 10 Agustus 1806, Salzburg), salah satu komposer musik gereja yang paling berhasil pada abad ke-18. Dia adalah adik laki-laki Joseph Haydn.
Seperti saudaranya, Michael Haydn menjadi anggota paduan suara di Katedral St. Stephen di Wina, menerima instruksi musik awalnya di sana. Dia dipecat dari sekolah paduan suara ketika suaranya pecah, dan dia kemudian mencari nafkah yang genting sebagai musisi lepas. Pada 1757 ia menjadi kapellmeister untuk uskup Grosswardein di Hongaria (sekarang Oradea, Rom.), Dan pada 1762 ia menjadi ketua konser ke uskup agung Salzburg. Dia tetap di Salzburg sebagai pemimpin konser selama sisa hidupnya dan menggantikan Wolfgang Amadeus Mozart sebagai organ katedral pada 1781.
Selama masa hidupnya Michael Haydn dianggap sebagai komposer musik gereja yang lebih baik daripada saudaranya. Dari sekian banyak massa yang ia tulis, Missa a due cori (juga dikenal sebagai Missa Hispanica; 1786) adalah karya yang luar biasa untuk orkestra dan solois vokal, dan Requiem-nya pada 1771 memengaruhi Requiem terkenal Mozart sendiri pada tahun 1791. Haydn juga menulis banyak simfoni, berbeda, dan komposisi sekuler lainnya. Dia adalah teman dekat Mozart (yang menulis duo biola-biolanya untuk memenuhi tugas yang tidak bisa diselesaikan Haydn) dan merupakan guru Carl Maria von Weber. Setelah kematiannya, reputasi Haydn mengalami gerhana yang panjang, dan baru setelah Perang Dunia II jasanya jasa itu diakui lagi.
