Kapsul dan lapisan lendir
Banyak sel bakteri mengeluarkan beberapa bahan ekstraseluler dalam bentuk kapsul atau lapisan lendir. Lapisan lendir secara longgar terkait dengan bakteri dan dapat dengan mudah dicuci, sedangkan kapsul melekat erat pada bakteri dan memiliki batas-batas yang pasti. Kapsul dapat dilihat di bawah mikroskop cahaya dengan menempatkan sel dalam suspensi tinta India. Kapsul tidak termasuk tinta dan muncul sebagai lingkaran cahaya bening di sekitar sel bakteri. Kapsul biasanya polimer dari gula sederhana (polisakarida), meskipun kapsul Bacillus anthracis terbuat dari asam poliglutamat. Sebagian besar kapsul bersifat hidrofilik (“menyukai air”) dan dapat membantu bakteri menghindari pengeringan (dehidrasi) dengan mencegah kehilangan air. Kapsul dapat melindungi sel bakteri dari konsumsi dan perusakan oleh sel darah putih (fagositosis). Sementara mekanisme yang tepat untuk keluar dari fagositosis tidak jelas, hal itu dapat terjadi karena kapsul membuat komponen permukaan bakteri lebih licin, membantu bakteri untuk keluar dari proses menelan oleh sel-sel fagosit. Kehadiran kapsul dalam Streptococcus pneumoniae adalah faktor terpenting dalam kemampuannya menyebabkan pneumonia. Strain mutan S. pneumoniae yang telah kehilangan kemampuan untuk membentuk kapsul siap diambil oleh sel darah putih dan tidak menyebabkan penyakit. Asosiasi virulensi dan pembentukan kapsul juga ditemukan pada banyak spesies bakteri lain.
Lapisan kapsul bahan polisakarida ekstraseluler dapat membungkus banyak bakteri ke dalam biofilm dan melayani banyak fungsi. Streptococcus mutans, yang menyebabkan karies gigi, membelah sukrosa dalam makanan dan menggunakan salah satu gula untuk membangun kapsulnya, yang melekat erat pada gigi. Bakteri yang terperangkap dalam kapsul menggunakan gula lain untuk memicu metabolisme mereka dan menghasilkan asam kuat (asam laktat) yang menyerang enamel gigi. Ketika Pseudomonas aeruginosa mengkolonisasi paru-paru orang dengan fibrosis kistik, Pseudomonas aeruginosa menghasilkan polimer kapsul yang tebal dari asam alginat yang berkontribusi pada sulitnya memberantas bakteri. Bakteri dari genus Zoogloea mensekresikan serat selulosa yang membungkus bakteri menjadi flok yang mengapung di permukaan cairan dan membuat bakteri terpapar ke udara, suatu kebutuhan untuk metabolisme genus ini. Beberapa bakteri berbentuk batang, seperti Sphaerotilus, mengeluarkan selubung tubular kimiawi panjang yang kompleks yang membungkus sejumlah besar bakteri. Sarung ini dan banyak bakteri lingkungan lainnya dapat menjadi bertatah dengan besi atau oksida mangan.
Flagella, fimbriae, dan pili
Banyak bakteri yang bergerak, mampu berenang melalui media cair atau meluncur atau berkerumun di permukaan yang padat. Bakteri yang berenang dan berkerumun memiliki flagela, yang merupakan pelengkap ekstraseluler yang diperlukan untuk pergerakan. Flagela adalah filamen heliks yang panjang, terbuat dari satu jenis protein dan terletak di ujung sel berbentuk batang, seperti pada Vibrio cholerae atau Pseudomonas aeruginosa, atau di seluruh permukaan sel, seperti pada Escherichia coli. Flagella dapat ditemukan pada kedua batang gram positif dan gram negatif tetapi jarang pada cocci dan terjebak dalam filamen aksial dalam spirochetes. Flagel terpasang di alasnya ke tubuh basal di membran sel. Kekuatan protrobo yang dihasilkan pada membran digunakan untuk mengubah filamen flagel, dengan cara turbin yang digerakkan oleh aliran ion hidrogen melalui tubuh basal ke dalam sel. Ketika flagela berputar dalam arah yang berlawanan, sel bakteri berenang dalam garis lurus; Rotasi searah jarum jam menghasilkan berenang dalam arah yang berlawanan atau, jika ada lebih dari satu flagel per sel, jatuh secara acak. Chemotaxis memungkinkan bakteri untuk menyesuaikan perilaku berenangnya sehingga dapat merasakan dan bermigrasi ke arah peningkatan tingkat bahan kimia penarik atau jauh dari penolak.
Bakteri tidak hanya dapat berenang atau meluncur menuju lingkungan yang lebih baik, tetapi mereka juga memiliki embel-embel yang memungkinkan mereka melekat pada permukaan dan menjaga agar tidak hanyut oleh cairan yang mengalir. Beberapa bakteri, seperti E. coli dan Neisseria gonorrhoeae, menghasilkan proyeksi lurus, kaku, spikelike yang disebut fimbriae (bahasa Latin untuk "benang" atau "serat") atau pili (bahasa Latin untuk "rambut"), yang memanjang dari permukaan bakteri dan menempel pada gula spesifik pada sel-sel lain — untuk strain ini, sel epitel usus atau saluran kemih, masing-masing. Fimbriae hanya ada dalam bakteri gram negatif. Pili tertentu (disebut pili jenis kelamin) digunakan untuk memungkinkan satu bakteri mengenali dan mematuhinya dalam proses kawin seksual yang disebut konjugasi (lihat di bawah reproduksi bakteri). Banyak bakteri akuatik yang menghasilkan tahan asam mucopolysaccharide, yang memungkinkan mereka melekat erat pada batu atau permukaan lainnya.
