Dalam representasi artistik yang berbeda, bangunan pusat Angkor Wat telah muncul di bendera nasional Khmer sejak abad ke-19, pada masa-masa awal protektorat Prancis atas Kamboja. Bendera pertama merah berbatasan dengan biru dengan candi dalam warna putih. Bendera itu "dimodernisasi" pada tahun 1948 dengan mengadopsi garis-garis horizontal biru tua, merah, dan biru gelap yang tidak setara, dan kuil itu diubah agar lebih sesuai dengan aslinya. Bendera itu terus digunakan setelah Kamboja merdeka. Namun, akhir dari monarki dan proklamasi Republik Khmer menghasilkan bendera baru pada Oktober 1970. "Bendera inti" menjadi wilayah, sementara lapangan berwarna biru dengan tiga bintang putih.
Pemberontak komunis pertama kali menggunakan bendera 1948-1970 tetapi berkuasa pada April 1975 di bawah bendera merah polos. Ketika Kampuchea Demokratik mereka mengadopsi konstitusi pada Januari 1976, sebuah siluet candi tiga menara berwarna kuning ditempatkan di tengah bendera merah, hanya digantikan oleh candi kuning lima menara ketika pasukan dukungan Vietnam memproklamasikan Republik Rakyat Kampuchea pada tahun 1979. Pemerintahan saingan "Negara Kamboja" (Khmer Merah) dan "Kamboja" (Vietnam) membentuk adaptasi bendera lebih lanjut sebelum administrasi PBB, yang mengibarkan bendera biru muda dengan peta siluet negara di tengahnya. Perserikatan Bangsa-Bangsa membantu mengakhiri pertikaian sipil, dan hal itu menyebabkan negara itu melakukan pemilihan umum bebas pada tahun 1993. Bendera 1948–70 kembali diangkat pada 30 Juni tahun itu.
