Ada dua sumber untuk warna putih-biru-merah dari bendera nasional Slovenia. Untuk spanduk etnis nasionalnya, Slovenia telah mengadopsi salinan bendera Rusia, untuk menunjukkan solidaritas dengan sesama bangsa Slavia, pada saat Perang Napoleon. Namun, lebih awal, kaisar Romawi Suci telah memberikan lambang kepada "Tanah Mahkota Carniola," yang saat itu merupakan bagian dari kekaisaran. Lambang ini menampilkan perisai putih bertuliskan elang biru dengan sabit kotak-kotak merah-putih di dadanya. Lambang penting lainnya dalam sejarah Slovenia adalah yang digunakan oleh daerah Celje — perisai biru dengan tiga bintang kuning. Akhirnya, di bawah rezim komunis abad ke-20, lambang Slovenia memiliki garis-garis horizontal bergelombang biru dan putih untuk menyarankan pantai Adriatik di negara itu, serta gunung tiga-puncak yang bergaya — gunung tertinggi di Slovenia, Triglav yang terkenal.
Slovenia memproklamasikan kemerdekaannya pada 25 Juni 1991, tetapi harus berjuang melawan tentara Yugoslavia untuk menegakkan kedaulatannya. Bendera yang diangkat pada Hari Kemerdekaan adalah tricolor pan-Slavic putih-biru-merah tradisional. Untuk membedakannya dari bendera serupa Rusia dan Slovakia, lambang baru Slovenia ditambahkan di sudut kerekan atas yang tumpang tindih dengan garis-garis putih dan biru. Perisai itu menampilkan kombinasi Triglav dan garis-garis bergelombang dari lengan komunis dengan bintang-bintang kuning pada latar belakang biru dari perisai Celje.
